П.А. Федотов в 2002 г. окончил Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова. В период 2003-2011 гг получил специализацию по терапии, кардиологии, анестезиологии-реаниматологии, тематическое усовершенствование «Клиническая трансплантация сердца». С 2005 по 2015 гг прошел путь от младшего до ведущего научного сотрудника. С 2011 года заведует НИЛ высокотехнологичных методов лечения сердечной недостаточности. Кандидатская диссертация (2010) — «Сердечная недостаточность у пациентов, имеющих хроническую обструктивную болезнь легких: возможности применения бета-адреноблокаторов». Автор цикла повышения квалификации для кардиологов, анестезиологов-реаниматологов, сердечно-сосудистых хирургов и педиатров «Лечение терминальной ХСН. Терапевтические аспекты Трансплантации сердца». С 2021 года — доцент кафедры кардиологии НМИЦ им. В.А. Алмазова Минздрава России. 
Область научных интересов П.А. Федотова — хроническая сердечная недостаточность, механическая поддержка кровообращения и трансплантация сердца. Пётр Алексеевич — автор и соавтор более 150 научных публикаций, включая 2 монографии и 2 учебных пособия. Член Российского кардиологического общества, Российского трансплантологического общества, член правления Общества специалистов по сердечной недостаточности.